Collaboration d’Eureka Genomics et du James Hutton Institute pour développer un nouveau test de génotypage de l’orge (AcT)

HERCULES, Californie, 11 janvier 2013 (GLOBE NEWSWIRE) -- Eureka Genomics est en train de développer un test personnalisé pour le génotypage de l'orge, permettant l'identification de plus de 400 polymorphismes de nucléotides simples avec un seul test. Coûtant 15 $ par échantillon, le test offre aux chercheurs un moyen abordable leur permettant d'identifier et d'optimiser les caractéristiques des récoltes commerciales, telles que le rendement, la qualité et la résistance environnementale.

L'orge est la 4^e plus importante céréale au monde et sa valeur économique est considérable à l'échelle internationale, notamment pour les industries de la brasserie et de la distillerie de whisky. Cette céréale est également utilisée dans l'alimentation animale et son potentiel est reconnu par la FDA comme pouvant contribuer à l'amélioration de la santé humaine. En développant le panel de l'orge en collaboration avec le James Hutton Institute (basé en Écosse, R.U.), Eureka Genomics se positionne pour lancer le test à la fois en Europe et aux États-Unis, le mois prochain. Une présentation détaillée du nouveau panel de l'orge aura lieu lors de la 21^e conférence « Plant and Animal Genome » qui se déroulera à San Diego en Californie le 13 janvier 2013.

« Cette collaboration a permis d'élaborer une approche à débit moyen très économique pour le génotypage des polymorphismes de nucléotides simples (PNS), une technologie fondamentale utilisée dans le monde entier, à la fois pour les études génétiques et les programmes contemporains d'amélioration des récoltes. Étant donné que la technologie d'Eureka est suffisamment souple pour augmenter, à la fois, le nombre de PNS et d'échantillons par test avec des coûts supplémentaires restant modestes, nous portons désormais notre attention sur l'amélioration de la représentation et de la capacité multiplex des PNS, afin de réduire encore davantage le coût par point de données, ce qui est un aspect clé pour l'adoption la plus large possible dans un contexte de culture commerciale des plantes », explique Robbie Waugh, directeur de la génétique au James Hutton Institute.

Par rapport aux technologies traditionnelles, le test de marqueur génétique (LDMA) proposé par Eureka Genomics représente une alternative améliorée et économique de profilage de centaines de PNS (ou autres marqueurs génétiques) dans des milliers d'échantillons, en utilisant la technologie de séquençage de nouvelle génération (NGS). Ce test polyvalent peut servir à la détection des PNS et des VNC, la présence/absence et la méthylation. Le test est compatible avec l'ADN et l'ARN de pratiquement n'importe quel organisme même lorsque les informations du génome sont incomplètes. « Le LDMA permet aux chercheurs de concevoir des panels de profilage ciblant les marqueurs les plus importants pour leur projet, plutôt que de perdre du temps et des ressources à obtenir des données sans intérêt par rapport à leurs objectifs », estime Andrea White, directrice du développement commercial pour Eureka Genomics. « L'utilité du test a été démontrée et validée et nous sommes impatients de lancer différentes recherches collaboratives, telle que celle que nous avons établie avec le James Hutton Institute, afin d'étendre le portefeuille de tests proposés par Eureka Genomics et répondre aux besoins mondiaux dans les domaines végétal, animal et clinique. »
 

À propos d'Eureka Genomics : Eureka Genomics (EG ; www.eurekagenomics.com) est un leader en matière d'analyse bioinformatique avancée des données obtenues par séquençage de nouvelle génération, une activité essentiellement associée à ses tests de marqueur génétique à faible densité (LDMA). Par ailleurs, EG utilise son expertise analytique pour découvrir les micro-organismes des cancers et d'autres pathologies fatales et élaborer les diagnostics moléculaires correspondants. EG utilise des algorithmes exclusifs et son expertise en résolution des problèmes biologiques pour fournir des services de séquençage collaboratifs, économiques et de haute qualité à un éventail important d'universités, d'administrations et de chercheurs industriels dans le monde entier. Pour plus de renseignements, veuillez contacter Didier Perez, 415 269 0666. didier@eurekagenomics.com. Venez nous rendre visite à l'occasion de la 21^e conférence PAG à San Diego, en Californie au stand 206.

À propos du James Hutton Institute : Le James Hutton Institute est un tout nouveau centre international de recherche basé en Écosse. Nous nous situons à l'avant-garde de la recherche mondiale et nous consacrons nos efforts pour relever les défis planétaires les plus urgents, y compris l'impact du changement climatique et les menaces pesant sur la sécurité alimentaire et l'eau. Le James Hutton Institute est le résultat de la fusion du Macaulay Land Use Research Institute et du SCRI (Scottish Cro Research Institute), deux organisations aux antécédents prestigieux. Le nouvel institut a été fondé le 1^er avril 2011. Pour plus de renseignements, veuillez consulter : info@hutton.ac.uk