Epigenomics et l'institut Wellcome Trust Sanger annoncent le lancement du projet sur l'épigénome humain (HEP) pour faire suite à l'étude pilote dirigée par l'UE

Berlin (Allemagne), Seattle (Washington) et Cambridge (R.U.), October 07 /PRNewswire/ -- Epigenomics AG et l'institut Wellcome Trust Sanger ont annoncé aujourd'hui un accord pour le financement et la réalisation de la première phase du projet sur l'épigénome humain (HEP). Le projet HEP va permettre d'identifier et de décrire les sites du génome humain au niveau desquels les bases cytosine sont modifiées par méthylation de l'ADN (voir commentaires ci-dessous). Ce communiqué fait suite au succès de l'achèvement de l'étude pilote du HEP financée par l'Union Européenne (FP5) : les données relatives à l'étude pilote sont publiées aujourd'hui sur le site Web du HEP.

Les changements à la séquence d'ADN, l'ordre de A, T, G et C dans notre code génétique et leur rôle dans la santé et les maladies sont de mieux en mieux interprétés grâce à l'achèvement de la séquence du génome humain. Mais nos cellules utilisent des couches supplémentaires de contrôle des gènes et la méthylation de l'ADN est l'un des régulateurs le plus important de l'activité des gènes. Non seulement la méthylation est importante dans le développement normal, mais ses changements sont détectés dans le cadre de nombreux cancers et de certains troubles de développement tel que le syndrome de Beckwith-Wiedemann.

Du fait que la méthylation de l'ADN est modifiée dans le cas de plusieurs maladies et qu'elle est associée à la réponse de notre organisme aux médicaments et autres facteurs tel que l'âge, le HEP va fournir un lien crucial entre la génétique, l'environnement et la santé. L'intégration des informations génétiques et épigénétiques va non seulement nous permettre de comprendre comment et quand nos gènes sont activés ou désactivés mais aussi va accroître notre résistance aux maladies à la fois communes et complexes.

" La cartographie de tous les sites de méthylation de l'ADN promet une meilleure compréhension de la base biologique de la maladie et peut éventuellement permettre un diagnostic précoce, " selon le docteur Kurt Berlin, conseiller scientifique en chef chez Epigenomics.

Dans la cadre de cette collaboration, Epigenomics va utiliser son expertise des analyses de méthylation à haut rendement, tandis que l'institut Wellcome Trust Sanger va contribuer à la technologie de séquençage à haut rendement. Des échantillons de tissue seront fournis par des sources commerciales ainsi que par des partenaires académiques. Après la préparation particulière à la méthylation effectuée par Epigenomics, le séquençage sera appliqué aux échantillons par l'institut Wellcome Trust Sanger.

Les données de méthylation obtenues seront intégrées dans la séquence du génome humain et publiées sur les sites http://www.epigenome.org/ et http://www.sanger.ac.uk/epigenome selon les directives de diffusion des données du consortium (voir ci-dessous). L'achèvement du HEP est prévu pour d'ici cinq ans.

Epigenomics et l'institut Wellcome Trust Sanger font tous deux partie du Human Epigenome Consortium (HEC) fondé en 1999 et qui inclut également le Centre National de Génotypage (Paris, France). Le HEC est une collaboration publique/privée destinée à identifier et cataloguer les positions variables de méthylation (MVP) dans le génome humain.

Remarques

Méthylation de l'ADN

La méthylation est un processus naturel qui survient le plus souvent sur une des quatre paires de base, la cytosine. La présence de la méthylation peut modifier l'activité des gènes. Les différences du modèle de méthylation entre un tissu sain et malade peuvent être détectées et peuvent indiquer un changement de l'activité des gènes qui entraîne les maladies comme le cancer. Toutefois, notre connaissance des changements causés par méthylation reste limitée. Le HEP va donc fournir une carte des ces sites de méthylation permettant ainsi de lier la séquence des gènes à la régulation.

Méthylation de l'ADN et maladie

Les changements de la méthylation sont détectés pour le cancer et jouent également un rôle dans le cadre de plusieurs troubles du développement tels que les syndromes de Beckwith-Wiedemann (BWS), de Prader-Willi et d'Angelman. Dans le cas du BWS, la méthylation aberrante des gènes H19 et LIT1 est associée à des effets plus extrêmes et à une prédisposition au cancer.

Projet pilote

Le consortium a récemment achevé une étude pilote financée par l'UE sur les modèles de méthylation dans le cadre du complexe majeur d'histocompatibilité (CMH), une région du chromosome 6 associée à davantage de maladies que toute autre région du génome humain. Au total, l'état de méthylation de bien plus que 100 000 sites a été déterminé et a permis de découvrir des différences majeures du modèle de méthylation entre tissus. Pour pouvoir intégrer les données de méthylation aux commentaires existants du génome et pour les rendre publiques, une nouvelle visionneuse de la méthylation a été développée à l'aide de l'interface populaire ENSEMBL ( http://www.epigenome.org/ et http://www.sanger.ac.uk/epigenome).

Directives de diffusion des données ( http://www.epigenome.org/index.php?page=release)

Les MVP seront créés en lots. Après 120 jours, les données de chaque lot complété seront publiées à l'adresse http://www.epigenome.org/. Aucune licence stipulée ou implicite n'est octroyée pour l'utilisation commerciale des données publiées. Les entités non commerciales peuvent utiliser les données uniquement à des fins de recherche non commerciale. Pour éviter tout doute éventuel, les données sont sujettes aux applications déposées des directives de propriété intellectuelle et de brevet de Wellcome Trust.

À propos de l'institut Wellcome Trust Sanger

Le Sanger Institute est un institut de recherche sur le génome financé principalement par Wellcome Trust. Notre vocation est d'approfondir la connaissance des génomes, particulièrement par le biais de séquençages et d'analyses à grande échelle. Le Wellcome Trust est un organisme charitable et indépendant de recherche fondé en 1936 sous la volonté de Sir Henry Wellcome. Il est financé par une fondation privée qui le gère dans un soucis de stabilité et de croissance à long terme. La mission du trust est d'encourager et de promouvoir la recherche dans le but d'améliorer la santé des humains et des animaux. À propos de

Epigenomics

Epigomenics s'est engagé à personnaliser la médecine dans le domaine du cancer et autres maladies complexes en développant des nouveaux produits de diagnostic, pharmacodiagnostic et de recherche. En détectant et en interprétant les modèles numérisés de méthylation de l'ADN, les signes " d'activation " et " de désactivation " des gènes, Epigenomics permet d'établir de façon précoce un diagnostic exact et de sélectionner la thérapeutique appropriée. Le siège social de la société est à Berlin en Allemagne avec une filiale à 100% à Seattle aux E.U. Pour plus d'informations, veuillez visitez notre site Web à http://www.epigenomics.com/.