Enamine fournira des bibliothèques de fragments équilibrés DSI et d'analogues au site XChem de Diamond Light Source et aux initiatives de criblage du SGC Oxford

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La bibliothèque de fragments équilibrés Diamond-SGC-iNEXT soutient l'élaboration rapide de fragments pour le développement de sondes chimiques et de médicaments

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Enamine fournira des bibliothèques de fragments équilibrés DSI et d'analogues au site XChem de Diamond Light Source et aux initiatives de criblage du SGC Oxford

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Zyme Communications
Lorna Cuddon
E: lorna.cuddon@zymecommunications.com
T: +44 7811996942

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Diamond Light Source (Diamond) et le Structural Genomic Consortium (SGC) Oxford, ont annoncé aujourd'hui qu'Enamine, une société chimique et un producteur d'éléments chimiques novateurs et de bibliothèques de criblage, deviendra un fournisseur clef de bibliothèques de fragments équilibrés et d'analogues pour son site XChem. Enamine fournira une nouvelle génération de la bibliothèque à succès -la bibliothèque de fragments équilibrés Diamond-SGC-iNEXT (DSI)- pour permettre des découvertes rapides et productives basées sur des fragments.

Diamond, en collaboration avec le SGC Oxford, a mis sur pied le site XChem pour le criblage fragmentaire par cristallographie aux rayons X afin d'assurer l'accès public à des découvertes basées sur des fragments efficaces. En outre, pour permettre un développement rapide et productif, cette collaboration a élaboré le concept de "fragments équilibrés" (Cox et al., Chemical Science, 2016), qui constitue l'axe principal de sa stratégie de criblage. La découverte basée sur des fragments est une approche commune dans les cercles universitaires et industriels pour le développement de nouvelles sondes chimiques et de nouveaux points de départ médicamenteux (ou repères) à partir d'une preuve initiale insuffisante (ou résultats fragmentaires). Ces résultats doivent être altérés chimiquement pour améliorer leur force de liaison à la protéine cible, entre autres propriétés.

La bibliothèque de fragments équilibrés DSI comprend 768 fragments hautement solubles. Chaque composé est accompagné de son propre espace chimique virtuel, qui est directement accessible pour une synthèse et disponible à l'achat par l'intermédiaire d'Enamine. Tout résultat obtenu à partir de cette bibliothèque peut être développé par une chimie de suivi dans un délai maximal de trois semaines d'utilisation de la base de données REAL d'Enamine.

Prof Frank von Delft, chef de la collaboration XChem et scientifique principal des lignes de faisceaux au Diamond Light Source, explique: "Le site XChem a déjà aidé plus de 60 utilisateurs à trouver des milliers de résultats avec plus de 80 cibles. Pour relever le défi suivant, c'est-à-dire une élaboration chimique généralement coûteuse et chronophage, nous avons mis au point et publié l'approche de fragments équilibrés. Ces fragments peuvent être synthétisés en une seule étape à partir de matériaux initiaux disponibles dans le commerce à l'aide de réactions stables et à haut rendement, de manière à ce que les bibliothèques d'analogues puissent être synthétisées rapidement et à moindre coût. Associée à des méthodes biophysiques hautement performantes, comme le criblage XChem, mais aussi la RMN ou la RPS, cette approche devrait fournir un moyen rentable pour élaborer des recherches préliminaires basées sur les fragments."

Le Dr Anthony Bradley, chef de projet sur le développement fragmentaire au SGC Oxford, ajoute: "Nous avons rapidement découvert que pour tirer parti de cette approche, nous avions besoin de traiter urgemment la question de l'approvisionnement du composé. Nous sommes donc ravis de travailler avec Enamine à la concrétisation de la bibliothèque de fragments équilibrés DSI, qui bénéfice pleinement de l'important stock d'éléments chimiques, des capacités et des solutions éprouvées d'Enamine. Cela permet de placer la bibliothèque primaire et la série analogue de suivi dans les limites budgétaires et dans les délais d'initiatives similaires de découverte de composés à l'échelle mondiale. Le SGC Oxford utilisera de manière soutenue ces ressources au cours de ses nombreux projets, actuels et futurs, de développement de composés."

Michael Bossert, responsable des alliances stratégiques chez Enamine, déclare: "Le degré technologique élevé de spécialisation de Diamond et son site XChem unique en son genre, ont joué un rôle clef dans cette collaboration. Il est important de travailler avec des sociétés hi-tech afin de créer des produits à haute valeur technologique ajoutée visant à optimiser les efficiences de R&D de nos clients et la réussite de leurs projets de découverte."

Le professeur Paul Brennan, chercheur principal en chimie médicale au SGC Oxford, et auteur principal de la première publication, poursuit: "Il est extrêmement gratifiant de voir que notre bibliothèque de fragments équilibrés Diamond-SGC d'origine et notre approche de fragments équilibrés prennent une envergure commerciale. Nous espérons que cela lui permettra de devenir un outil essentiel dans l'accélération du développement de sondes et de médicaments à petites molécules."

La bibliothèque sera mise à disposition d'un groupe non exclusif de neuf instituts de recherche effectuant des criblages par rayons X et RMN, situés en Europe, aux États-Unis et en Chine. Les instituts européens incluent les partenaires de l'initiative de criblage fragmentaire iNEXT: Diamond, EMBL et ESRF (Grenoble), NKI (Amsterdam), BMRZ (Francfort), FMP (Berlin) et CIRMMP (Florence). Les scientifiques souhaitant utiliser la bibliothèque pour leurs propres recherches sont invités à le faire.

Pour de plus amples renseignements sur la bibliothèque de fragments équilibrés DSI: https://xchem.github.io/oxxchem/DSI_poised_fragment_library.xlsx

FIN

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