Parse Biosciences lance un flux de travail pour l'analyse du répertoire immunitaire et du transcriptome
Parse Biosciences lance un flux de travail pour l'analyse du répertoire immunitaire et du transcriptome
Kaitie Kramer
kkramer@parsebiosciences.com | 858.504.0455
Parse Biosciences, le principal fournisseur de solutions de séquençage unicellulaire accessibles et évolutives, a annoncé aujourd'hui le lancement d'un flux de travail entièrement intégré pour l'analyse du répertoire immunitaire et du transcriptome complet dans sa plateforme d'analyse de données, Trailmaker™. Cette nouvelle fonctionnalité complète la gamme actuelle de produits immunitaires Evercode de Parse afin de permettre aux chercheurs de bénéficier d'un flux de travail complet de bout en bout.
Les immunologistes ne disposaient jusqu’ici d’aucune plateforme intégrée, conçue spécifiquement pour relier les données de répertoire immunitaire aux analyses de cellules uniques fondées sur le transcriptome complet. En conséquence, l’interprétation des comportements clonaux, la compréhension des états fonctionnels des cellules et l’élaboration de conclusions biologiques pertinentes ont souvent nécessité l’assemblage d’outils fragmentés, de code personnalisé ou de méthodes de visualisation hétérogènes. La nouvelle fonctionnalité Trailmaker répond directement à ces défis en proposant une solution accessible et de bout en bout pour le profilage immunitaire, qui réunit les informations de répertoire et de transcription au sein d’un environnement cohérent.
La nouvelle fonctionnalité combine les données du répertoire immunitaire et du transcriptome complet pour offrir aux chercheurs une vue d'ensemble de la structure clonale, de la diversité et des signatures antigéniques. Les utilisateurs peuvent visualiser les clonotypes et les types cellulaires sur un UMAP intégré, identifier rapidement les clones dominants à l'aide de graphiques de fréquence et en nid d'abeille, et utiliser une analyse de motifs unique pour détecter les modèles conservés. En reliant les données du répertoire à l'expression transcriptomique complète, Trailmaker facilite la connexion des clonotypes à leurs états transcriptionnels, révèle les programmes génétiques spécifiques aux clonotypes et exécute une expression différentielle ciblée, offrant ainsi des informations biologiques plus approfondies et plus contextualisées.
« Notre objectif a toujours été de supprimer les obstacles pour les chercheurs », explique Charlie Roco, PhD, cofondateur et directeur technique chez Parse. « En rendant le profilage immunitaire intuitif et plus intégré, nous permettons aux immunologistes de passer moins de temps à traiter les données et plus de temps à leur attribuer une signification biologique. »
Pour en savoir plus, participez au prochain webinaire éducatif de l'entreprise qui aura lieu le 29 janvier à 8 h, heure du Pacifique : https://parse.bio/45bmrJT.
À propos de Parse Biosciences
Parse Biosciences est une entreprise mondiale dans les sciences du vivant ayant pour mission d'accélérer les progrès de la santé humaine et de la recherche scientifique. Permettant aux chercheurs d'effectuer le séquençage de cellules uniques avec une facilité et une ampleur inégalée, son approche novatrice a permis des découvertes révolutionnaires dans le traitement du cancer, la réparation tissulaire, le traitement par cellules souches, les maladies rénales et hépatiques, le développement cérébral et le système immunitaire.
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