Synamatix annonce la sortie de solutions bioinformatiques pour séquenceurs de seconde génération
KUALA LUMPUR, Malaisie, April 24 /PRNewswire/ --
Synamatix a annoncé aujourd'hui la sortie de deux nouvelles applications logicielles conçues pour traiter et analyser les données de projets de reséquençage à grande échelle conduits sur des plateformes de séquençage d'ADN de seconde génération.
Robert Hercus, Directeur Général de Synamatix, a commenté que << SXOligosearch(TM) et une version modifiée de SynaSearch(TM) ont été produites pour faire face à l'explosion rapide de données résultant de l'utilisation croissante des plateformes de séquençage d'ADN 454-Roche et Solexa-Illumina. Ces applications ont été développées dans le cadre d'une stratégie actuelle visant à compléter une suite d'applications haut débit pour traiter, analyser et intégrer les données de chaque type de séquenceur d'ADN de seconde génération >>.
La première application, SXOligosearch, est conçue pour cartographier de courtes séquences telles que des lectures du séquenceur de génome Solexa- Illumina ou des sondages de microéchantillons d'oligonucleotides. Elle offre un très haut degré de flexibilité, permettant de gérer une grande variété d'erreurs de lecture ou mutations. De plus, on observe une performance 100 fois supérieure en comparaison avec les outils conventionnels. A la différence d'autres outils standard d'alignement, SXOligosearch aligne des lectures complètes plutôt que des HSPs, ayant pour résultat une plus grande spécificité et sensibilité. Elle est aussi capable de gérer des lectures de basse qualité contenant n'importe quel nombre de discordances, insertions ou suppressions avec une haute exactitude et une performance supérieure.
Une nouvelle version de SynaSearch, modifiée pour traiter et cartographier les lectures des plateformes GS20 et FLX de 454, vient également de sortir. Grâce à une optimisation approfondie, l'exactitude et la spécificité ont augmenté, et la performance est 200 fois supérieure en comparaison avec les approches standard.
En utilisant SynaBASE(TM) comme plateforme commune, différents types de lectures peuvent être mélangés pour augmenter la couverture et approfondir le support pour les différences qui sont identifiées entre les ensembles de données.
Les autres applications à haute performance de Synamatix basées sur SynaBASE, sa plateforme structurée unique de bases de données en réseau, comprennent SynaTree(TM), SXPRESearch(TM) et SXProbeDB(TM).
A propos de Synamatix
La technologie fondamentale à la base des applications logicielles de Synamatix est la plateforme exclusive << SynaBASE >>. Les applications construites à partir de cette plateforme de bases de données présentent une amélioration très significative en extensibilité, sensibilité et performance. Synamatix est une société privée bioinformatique de prochaine génération dont les activités primaires sont basées sur des projets continus de R&D relatifs à sa technologie centrale, le développement de nouvelles applications logicielles, et le support de sa base d'utilisateurs aux Etats-Unis, en Europe, Asie et Australie.
Contact Patricia Chan Marketing et Communications Synamatix Sdn. Bhd. Tel : +60-3-2283-1820 Courrier électronique : enquiries@synamatix.com www.synamatix.com
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