L'Institut américain du cancer utilise le « dynamic array » 96.96 de Fluidigm pour effectuer le suivi rapide et économique des analyses d'association SNP à l'échelle du génome entier

Fluidigm a annoncé aujourd’hui que le National Cancer Institute (Institut américain du cancer, NCI), l’agence principale de recherche sur le cancer du gouvernement des États-Unis, utilisait le système d’ingénierie génétique BioMark™ de Fluidigm pour effectuer le suivi rapide et économique de ses analyses d’association SNP à l’échelle du génome entier.

Le centre de génotypage central du NCI utilise les « dynamic arrays » 96.96 BioMark de Fluidigm pour effectuer un génotypage SNP (Single Nucleotide Polymorphism (Polymorphisme d’un nucléotide simple)) medium-plex. L’un des objectifs clés du programme est d’accélérer les efforts visant à répliquer et publier les marqueurs de susceptibilité génétique les plus prometteurs impliqués par les nombreuses analyses d’association à l’échelle du génome entier (genome-wide association scans (GWAS)) en cours au NCI.

« Le nouveau « dynamic array » 96.96 de Fluidigm permet au NCI d’élargir de manière significative ses offres de service dans la recherche sur le génotypage du cancer », a déclaré Gajus Worthington, le président-directeur général de Fluidigm. « On a utilisé nos arrays 48.48 avec succès et, dans les tests de comparaison, les nouveaux arrays 96.96 de Fluidigm ont été exceptionnellement performants. »

« Le centre de génotypage central du National Cancer Institute collabore avec des chercheurs dans d’autres centres de recherche gouvernementaux et des institutions universitaires en vue de développer des dépistages pour identifier les personnes prédisposées à des formes particulières du cancer », a ajouté Gajus Worthington. « Notre « dynamic array » 96.96 donne des taux de succès de plus de 99 % et peut traiter plus de 70 000 génotypes par jour. »

Le NCI a réalisé une étude de suivi GWAS sur le cancer de la prostate en utilisant environ 60 SNP, testés sur 15 000 échantillons, avec une chimie PCR de la nucléase 5’ standard et des « dynamic arrays » BioMark™. Les résultats de cette étude ont été présentés par Kevin Jacobs, le chef de projet de « genome scan » et responsable de son analyse au National Cancer Institute, lors de la réunion 2008 de la European Society of Human Genetics à Barcelone, en Espagne, le 1^er juin 2008.

Fluidigm est l’inventeur des circuits fluidiques intégrés (IFC). Le système BioMark de la société utilise une technologie de circuit fluidique intégré (IFC) visant à réduire la complexité, à améliorer le débit, à assurer une précision de l’ordre du nanolitre et à fournir des économies de coût importantes (moins de réactif et échantillons plus petits) pour les applications de génotypage à haut débit. Le NCI peut faire migrer 96 échantillons contre 96 ensembles amorce/sonde, générant 9 216 réactions à la fois au moyen du nouveau « dynamic array » 96.96 de Fluidigm. Cet IFC ne nécessite que 192 étapes de pipetage (comparé à plus de 18 000 étapes de pipetage quand on effectue ce volume d’essais sur des microplaques à 384 puits standard).

Á propos de Fluidigm Corp.

Fluidigm développe, fabrique et commercialise des systèmes IFC (Integrated Fluidic Circuit (circuit fluidique intégré)) exclusifs qui améliorent considérablement la productivité dans la recherche en sciences de la vie. Les IFC de Fluidigm permettent d'effectuer simultanément des milliers de mesures biochimiques sophistiquées sur une échelle volumétrique extrêmement infime. Ces « circuits intégrés pour biologie » sont obtenus en miniaturisant et en intégrant des composants de manipulation liquides sur un seul dispositif microfabriqué. Les systèmes IFC de Fluidigm, qui sont constitués d’instrumentation, de logiciels et de circuits IFC à usage unique, augmentent le débit, réduisent les coûts et améliorent la sensibilité, par rapport aux systèmes de laboratoire conventionnels. Les produits Fluidigm n’ont pas été homologués ni approuvés par la Food and Drug Administration pour être utilisés comme diagnostic et ne sont disponibles que pour la recherche.

Pour en savoir plus, consultez le site www.Fluidigm.com.

Fluidigm, le logo Fluidigm, Topaz, BioMark, et NanoFlex sont des marques de commerce de Fluidigm Corporation.

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